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实验室科研团队揭示RhoE的生物学和功能特性

日期:2020-11-17   点击数:

RhoE/Rnd3是一种Ras GTP酶超家族成员,前期已经报道在慢性心衰时其表达较非心衰心脏组织中水平下降,提示RhoE在心血管系统中具有非常重要的作用。2020年8月,实验室科研团队揭伟、郭峻莉等以通讯作者在Int J Mol Med(IF=4.102)发表题为《Ingenuity pathway analysis of differentially expressed genes involved in signaling pathways and molecular networks in RhoE gene?edited cardiomyocytes》的研究论文。在本研究中,使用CRISPR/Cas9技术建立了RhoE敲除的H9C2心肌细胞系,然后使用全基因组表达基因芯片筛选RhoE敲除和野生型细胞系之间的差异表达基因(DEG),结果共鉴定了829个DEG,包括417个上调和412个下调。以?Log(P值)>2为标准,发现67条典型通路被富集,许多富集的通路与炎症反应有关。随后的疾病和功能分析表明,除了心血管疾病和发育功能外,RhoE还可能参与其他疾病和功能,包括生物体存活、癌症、生物体损伤和异常、细胞间信号传导和相互作用以及分子转运。此外,还富集了885个上游调节因子,其中预测为强烈激活的59个分子(Z-score >2)和预测显着抑制的分子(Z-scores <-2)60个。值得注意的是,发现33个调节效应和25个互作网络与DEG相关。其中,调节作用最显著的是“内皮细胞的粘附”和“髓系细胞的募集”,最重要的网络是“神经系统疾病”、“遗传性疾病、机体损伤和异常'。总之,本研究分析了RhoE涉及的经典信号通路、疾病和功能分类、上游调控分子、调控效应和相互作用网络。研究结果有助于发现RhoE的整体生物学和功能特性,并为RhoE在人类疾病,尤其是心血管系统疾病中的作用提供新的见解。

说明: E:\2020年文件\邵钟铭\Figures\Figure 5.tif

全文链接:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7388835/